האסיפה הכללית ו/או הוועד רשאים להקים ועדות נוספות על פי ראיית הצורך. הוועד ירכז בידיו את מלוא הסמכויות בהעדרן של ועדות נוספות. 

כל החלטה או תקנה מהחלטות ועדות המשנה אם ישנן כאלו אשר סותרות ו/או אינן מתיישבות ו/או מתנגדות עם החלטות ותקנות הוועד – בטלות מעיקרן.

בעיות אשר אינן מוצאות את פתרונן במסגרת ועד האיגוד, כגון בתחומים השייכים לוועדת ביקורת או ועדה אתית, תופנינה למוסדות המתאימים של ההסתדרות הרפואית בישראל.